阴凉干燥处保存
黑枸杞吸收水分后容易受潮变质，甚至发霉，在保存时可以用保鲜袋装好，选择阴凉干燥处来保存。
冰箱冷藏法
黑枸杞可以放在冰箱中保存，降低细菌的活性，使其保存时间更长一些，可以将黑枸杞装入保鲜袋中，然后放进冰箱冷藏即可，一般温度保持0-4度左右。
干燥剂保存
食品干燥剂是能吸附潮湿食物中的水分，帮助保持食物的干燥的，在保存黑枸杞时，可以在装黑枸杞的容器中放入小包食品干燥剂，能起到防潮的作用。
塑料真空保存法
在塑料袋中放入装有生石灰的小麻袋，再将去除杂质的黑枸杞放进塑料袋中，烤封塑料袋口，并抽出袋中空气，然后放置在阴凉处保存。要注意石灰不宜放多，也要多进行检查，以免出现漏气的现象。
霉变黑枸杞保存法
如果黑枸杞在保存过程中出现霉变情况，可以将霉变的黑枸杞放在圆簸箕中，双手将结块的先搓散，并且挑出严重变质的，喷淋适量白酒，湿润表面白斑处，双手搓除斑，反复多次，直至无斑。然后用微火焙干，并常用手轻搓翻动，使之散发水汽，出锅过筛，然后密封保存。
